王文
研究员
个人简介
中国科学院昆明动物所二级研究员。1989年毕业于武汉大学生物系,获学士学位。1992年在动物遗传学家施立明院士的指导下,于中国科学院昆明动物研究所获得硕士学位。1995年10月-1996年6月在美国哥伦比亚大学作访问学者。1996年在施立明和吴鹤龄教授指导下,在中国科学院昆明动物研究所获得博士学位。1997年8月至2002年7月,于美国芝加哥大学生态与进化学系担任博士后暨研究助理。长期以来一直进行进化基因组学研究,有丰富的基因组大数据处理经验。目前已经在Science,Nature,NatureGenetics,NatureBiotechnology,NatureCommunications,NatureReviewGenetics,PNAS,GenomeResearch,PlantCell,Genetics,TrendsinGenetics,GenomeBiology等重要学术杂志上发表多篇论文,其中第一和通讯(含共同通讯)作者SCI论文43篇,合作发表SCI论文30多篇。迄今论文被引用共计10000多次,Hindex为46。并担任《中国科学·生命科学》编委。
承担科研项目
2017年-2019年,国家基金委创新群体项目负责人,项目经费:600万元。
获奖及荣誉
2002年入选中科院昆明动物所马普青年科学家进化基因组学小组组长。
2003年获得国家杰出青年基金。
2004年“新世纪百千万人才工程国家级首批入选者”。
2007年和2012年作为首席科学家分别获得“973”项目的支持。
2008年获得中科院王宽诚西部学者杰出贡献奖和“谈家桢生命科学创新奖”。2010年获得“云南省自然科学一等奖”(第一完成人)。
2012年获得“国家自然科学二等奖”(第一完成人)。
2014年-2019年作为两个首席科学家之一获得一项中科院战略性先导专项(B类)。
2017年获得两项“云南省自然科学二等奖”(分别为第一完成人和第二完成人)。
2019年获得“云南省自然科学一等奖”(第三完成人)。
研究领域
在大数据和后基因组学时代,理解浩如烟海的基因组学数据、揭示重要表型特征的基因组和分子机制不仅是一个热门的话题,更是一个具有挑战性的科学课题。但最为重要的是,这些组学和实验技术的发展,为我们探寻自达尔文时代就提出的众多有趣、重要的生命现象的遗传和分子本质提供了前所未有的机会。本实验室侧重于在系统发育框架下,通过整合从宏观分类、多组学数据到实验验证等多层次数据,了解并探讨物种在进化历史过程中,重要表型特征进化的基因组基础和分子机制,最终希望以整合遗传、进化和发育的方式,了解遗传、表型形成和生物适应的关系。
在未来几年里,我们将主要以蝴蝶、发光昆虫等有重要表型特征的昆虫为研究对象,围绕物种系统发育和演化、基因组的进化机制、重要表型特征起源和进化等的遗传基础等进行研究,探讨昆虫的一些重要生命现象,试图在厘清昆虫系统发育关系的同时,解决重要的昆虫学的生物学问题。现阶段主要有以下研究方向:
1、以蝴蝶为例,整合多层次组学数据和实验数据,探讨蝴蝶表型特征多样性的演化。为了探讨形态多样性的遗传分子机制,自2010年开始,发展蝴蝶作为研究模式。我们在2015年完成所有蝴蝶模式种金凤蝶及其近缘种柑橘凤蝶两种凤蝶基因组,并以蝴蝶为例成功实现了野生昆虫基因编辑。在以蝴蝶作为研究模式的基础上,一方面继续以这两种生物为模式,通过基因编辑方法探讨基因对形态的影响,另一方面于2017年启动了蝴蝶系谱基因组计划,我们希望在一个大尺度的系统发育框架下,探讨蝴蝶重要表型特征的起源和进化,从而揭示蝴蝶多样性的遗传基础,并为蝴蝶在生态环境保护中的应用提供理论参考和实验基础。
2、以发光甲虫为例,开展发光甲虫的分类和系统发育研究,探讨生物荧光的起源与演化。我们自2002年开始以萤火虫等发光甲虫为研究对象,搭建和完善中国发光甲虫系统分类框、探讨萤火虫等发光甲虫的系统发育和演化,并在系统发育框下,整合多层次组学数据和实验数据,探讨发光甲虫及生物荧光起源与进化,我们旨在揭示生物荧光这一重要生命现象的遗传本质,同时也为萤火虫及其生物荧光的利用提供重要的理论基础和实践依据。
3、其它重要昆虫的研究。利用本实验室已搭建的现代昆虫学研究平台,我们也将对其它一些具有重要表型特征或重要价值的昆虫进化研究,通过对更多类群的探讨,揭示昆虫多样性及表型特征进化的遗传分子基础。
学术兼职
中国昆虫学会理事,云南昆虫学会理事
近期论文
1、ChenL,QiuQ,JiangY,WangK,LinZH,LiZP,BibiF,YangYZ,WangJH,NieWH,SuWT,LiuGC,LiQY,FuWW,PanXY,LiuC,YangJ,ZhangCZ,YinY,WangY,ZhaoY,ZhangC,WangZK,QinYL,LiuW,WangB,RenYD,ZhangR,ZengY,FonsecaR.R,WeiB,LiR,WanWT,ZhaoRP,ZhuWB,WangYT,DuanSC,GaoY,ZhangY,ChenCY,HvilsomC,EppsC,ChemnickL,DongY,MirarabS,SiegismundH,RyderO,GilbertM,LewinH,ZhangGJ*,HellerR*,WangW*.2019.Large-scaleruminantgenomesequencingprovidesinsightsintotheirevolutionanddistincttraits,Science,364(6446),2019.(ResearchArticle)(DOI:10.1126/science.aav6202).
2、WangY,ZhangCZ,WangNN,LiZP,HellerR,LiuR,ZhaoY,HanJG,PanXY,ZhengZQ,DaiXQ,ChenCS,DouML,PengSJ,ChenXQ,LiuJ,LiM,WangK,LiuC,LinZS,ChenL,HaoF,ZhuWB,SongCC,ZhaoC,ZhengCL,WangJM,HuSW,LiCY,YangH,JiangL,LiGY,LiuMJ,SonstegardT,ZhangGJ,JiangY*,WangW*,QiuQ*.2019.Geneticbasisofruminantheadgearandrapidantlerregeneration,Science,364(6446),2019.(ResearchArticle)(DOI:10.1126/science.aav6335).
3、LinZS,ChenL,ChenXQ,ZhongYB,YangY,XiaWH,LiuC,ZhuWB,WangH,YanBY,YangYF,LiuX,KvieK,R?edK,WangK,XiaoWH,WeiHJ,LiGY,HellerR,GilbertM,QiuQ*,WangW*,LiZP*.2019.BiologicaladaptationsintheArcticcervid,thereindeer(Rangifertarandus),Science,364(6446),2019.(ResearchArticle)(DOI:10.1126/science.aav6312).
4、WangK,ShenY,YangY,GanX,LiuG,HuK,LiY,GaoZ,ZhuL,YanG,HeL,ShanX,YangL,LuS,ZengH,PanX,LiuC,YuanY,FengC,XuW,ZhuC,XiaoW,DongY,WangW*,QiuQ*,HeS*.2019.MorphologyandgenomeofasnailfishfromtheMarianaTrenchprovideinsightsintodeep-seaadaptation.NatureEcologyEvolution(2019).3:823–833
5、LiuGC#,ChangZ#,ChenL#,HeJW#,DongZW,YangJ,LuSH,ZhaoRP,WanWT,ZhangR,WangW*,LiXY*.2019.Genomesizevariationinbutterflies(Insecta,Lepidotera,Papilionoidea):Athoroughphylogeneticcomparison.SystematicEntomology.Inpress.
6、LuSH#,YangJ#,DaiXL#,XieFA,HeJW,DongZW,MaoJL,LiuGC,ChangZ,ZhaoRP,WanWT,ZhangR,WangW*,LiXY*.2019.Chromosomal-levelreferencegenomeofChinesepeacockbutterfly(Papiliobianor)basedonthird-generationDNAsequencingandHi-Canalysis.GigaScience.8(11):pii:giz128.(doi:10.1093/gigascience/giz128)
7、LiuGC#,DongZW#,HouQB#,HeJW,ZhaoRP,WangW,LiXY*.2019.SecondrhagophthalmidluciferaseclonedfromChineseglow-wormMenghuoiusgiganteus(Rhagophthalmidae:Elateroidea).PhotochemPhotobiol.(doi:10.1111/php.13172)
8、ChenX#,DongZW#,LiuGC#,HeJW,ZhaoRP,WangW*,PenYQ*,LiXY*.2019.PhylogeneticanalysisprovidesinsightsintotheevolutionofAsianfirefliesandadultbioluminescence.MolecularPhylogeneticsandEvolution140,106600.(doi:10.1016/j.ympev.2019.106600)
9、LiuGC#,ZhangR#,HouQB,HeJW,DongZW,ZhaoRP,WangW,LiXY*.2019.CloningandcharacterizationofluciferasefromtheChinesefireflyLamprigerayunnana.PhotochemPhotobiol.95(5):1186-1194.(2018,IF=2.22)(https://doi.org/10.1111/php.13109)
10、HeJW#,BiWX#,DongZW,LiuGC,ZhaoRP,WangW*,LiXY*.2019.Themitochondrialgenomeofthefirstluminousclick-beetle(Coleoptera:Elateridae)recordedinAsia.MitochondrialDNAPartB-Resources.4(1):565-567.(2017,IF=0.488).(https://doi.org/10.1080/23802359.2018.1555019)
11、LiuGC,DongZW,HeJW,ZhaoRP,WangW,LiXY*.2017.Genomesizeof14speciesoffireflies(Insecta,Coleoptera,Lampyridae).ZoologicalResearch(2017,38(6):449-458).(DOI:10.24272/j.issn.2095-8137.2017.078.)(SCI-E).
12、LiXY#,LiuGC#,ShengWJ#,DongZW,ChenL,ZhaoRP,WangW*.2017.Genomeeditinginthebutterflytype-speciesPapiliomachaon.InsectScience.24,708-711,DOI10.1111/1744-7917.12421.
13、LiXY#,FanDD#,ZhangW#,LiuGC#,ZhangL#,ZhaoL,FangX,ChenL,DongY,ChenY,DingY,ZhaoRP,FengMJ,ZhuY,FengY,JiangXT,ZhuDY,XiangH,FengXK,LiSC,WangJ,ZhangGJ,KronforstMR*,WangW*.2015.OutbredgenomesequencingandCRISPR/Cas9geneeditinginbutterflies.NatureCommunications,6:8212.
14、ZhouZ,JiangY,WangZ,GouZ,LyuL,LiW,YuY,ShuL,ZhaoY,MaY,FangC,ShenY,LiuT,LiC,LiQ,WuM,WangM,WuY,DongY,WanW,WangX,DingZ,GaoY,XiangH,ZhuB,LeeS-H,WangW*,TianZ*.2015.Resequencing302wildandcultivatedaccessionsidentifiesgenesrelatedtodomesticationandimprovementinsoybean.NatureBiotechnology(2015),33(4):408-414.
15、JiangY,XieM,ChenWB,TalbotR,MaddoxJF,FarautT,WuCH,MuznyDM,LiYX,ZhangWG,StantonJA,BrauningR,BarrisWC,HourlierT,AkenBL,SearleSMJ,AdelsonDL,BianC,CamGR,ChenYL,ChengSF,DeSilvaU,DixenK,DongY,FanGY,FranklinIR,FuSY,Fuentes-UtrillaP,GuanR,HighlandMA,HolderME,HuangGD,InghamAB,JhangianiSN,KalraD,KovarCL,LeeSL,LiuWQ,LiuX,LuCX,LvT,MathewT,McWilliamS,MenziesM,PanSK,RobelinD,ServinB,TownleyD,WangWL,WeiB,WhiteSN,YangXH,YeC,YueYJ,ZengP,ZhouQ,HansenJB,KristiansenK,GibbsRA,FlicekP,WarkupCC,JonesHE,OddyVH,NicholasFW,McEwanJC,KijasJW,WangJ,WorleyKC,ArchibaldAL,CockettN,XuX,WangW*,DalrympleBP*.2014.Thesheepgenomeilluminatesbiologyoftherumenandlipidmetabolism.Science(2014)344:1168-73.
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17、DongY,XieM,JiangY,XiaoNQ,DuXY,ZhangWG,Tosser-KloppG,WangJH,YangS,LiangJ,ChenWB,ChenJ,ZengP,HouY,BianC,PanSK,LiYX,LiuX,WangWL,ServinB,SayreB,ZhuB,SweeneyD,MooreR,NeiWH,ShenYY,ZhaoRP,ZhangGJ,LiJQ,FarautT,WomackJ,ZhangYP,KijasJ,CockettN,XuX,ZhaoSH,WangJ*,WangW*.2013.Sequencingandautomatedwhole-genomeopticalmappingofthegenomeofadomesticgoat(Caprahircus).NatureBiotechnology(2013)31:135-141.
18、DingY,ZhouQ,WangW*.2012.OriginsofNewGenesandEvolutionoftheirNovelFunctions.AnnualReviewofEcology,Evolution,andSystematics(2012)43:345-363(invitedreview).
19、XuX,LiuX,GeS,JensenDJ,HuFY,LiX,DongY,GutenkunstNR,FangL,HuangLi,LiJX,HeWM,ZhangGJ,ZhengXM,ZhangFM,LiYR,YuC,KristiansenK,ZhangXQ,WangJ,WrightM,McCouchS,NielsenR,WangJ,WangW*.2012.Resequencing50accessionsofcultivatedandwildriceyieldsmarkersforidentifyingagronomicallyimportantgenes.NatureBiotechnology(2012)30:105-111.
20、XiangH,ZhuJD,ChenQ,DaiFY,LiX,LiMW,ZhangHY,ZhangGJ,LiD,DongY,ZhaoL,LinY,ChengDJ,YuJ,SunJF,ZhouXY,MaKL,HeYH,ZhaoYX,GuoSC,YeMZ,GuoGW,LiYR,LiRQ,ZhangXQ,MaLJ,KristiansenK,GuoQH,JiangJH,BeckS,XiaQY*,WangW*,WangJ*.2010.Singlebase–resolutionmethylomeofthesilkwormrevealsasparseepigenomicmap.NatureBiotechnology(2010)28:516-520.
21、ZhouQ,ZhangG,XuS,ZhaoR,LiX,DingY,WangW*.2008.OntheoriginofnewgenesinDrosophila.GenomeResearch(2008)18:1446-1455.
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25、WangW,BrunetFG,NevoE,LongM.2002.OriginofSphinx,ayoungchimericRNAgeneinDrosophilamelanogaster.Proc.Natl.Acad.Sci.USA(2002)99:4448-4453.
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