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文建凡

研究员

所属大学: 中国科学院昆明动物研究所

所属学院: 未知

邮箱:
wenjf@mail.kiz.ac.cn

个人主页:
http://sourcedb.kiz.cas.cn/zw/zjrc/200908/t20090813_2394231.html

个人简介

现为中科院昆明动物研究所研究员、博士生导师,学科带头人,国家重点实验室副主任

1996.7于中科院昆明动物研究所获动物学博士。1989.7于中科院昆明动物研究所获细胞生物学硕士。1986.7于湖南师范大学生物系获理学学士。

主要在分子和细胞两个层次上研究真核细胞的结构、功能机制和基因、基因组以及它们在不同进化地位生物(特别是低等单细胞生物类)中的多样性及其进化形成的机制,旨在从进化的视角阐明真核细胞(尤其是高等真核细胞)为什么具有如此这般的精细结构和精妙的功能活动机制,它们是怎样进化发展的,其进化的动力和机制规律是什么,以及真核细胞的进化如何为后续的生物多样性和复杂性的形成和大发展奠定基础的。以期达到对真核细胞本身乃至由其所构建的真核生物的认识从“知其然”深化到“知其所以然”的境界。基于上述基础研究的积累,近年来还从比较和进化基因组学的角度开展适应性进化的研究,以发掘有害生物(如“水华”蓝藻、恶性寄生虫如血吸虫等)的特异性防治靶标和开发利用高效、特殊的生物代谢途径(如藻类的非光合生长途径等)。已主持包括科技部973项目课题、国家自然科学基金重大研究计划项目、国家自然科学基金重点项目、国家自然科学基金面上项目、中科院重要方向项目、中科院重点部署项目和云南省重点项目等在内的科研项目20余项,参加10项。在包括“Genome.Biol.Evol.”“Mol.Biol.Evol.”、“BMCEvol.Biol.”、“Biol.Cell”、“Gene”、“J.Eukaryot.Biol.”、“Phycologia”、“CellRes.”、“PLoSONE”等SCI刊物在内的国内外核心刊物上发表论著60余篇。有3项研究成果获得省部级科技成果奖。迄今已招收培养硕士研究生17人,博士生17人。

承担科研项目

1.云南省基金重点项目(2013FA019):血吸虫适应性进化与疫苗防治靶标的发掘;主持

2.中国科学院重点部署项目(KSZD-EW-Z-011):青藏高原物种形成分化与适应机制参加

3.国家基金委面上项目(81271869);血吸虫消化酶系和能量代谢途径的寄生适应性进化与防治靶标的发掘主持

4.国家基金委优秀重点实验室项目(31123005);适应性进化的分子机制研究参加

5.国家基金委面上项目(31172081);几种寄生原生动物能量代谢途径适应性进化的基因组学研究主持

6.院创新知识重要方向项目(KSCXZ-EW-J-23);人和动物适应性进化的全基因组分子机制参加

7.科技部973项目课题(2007CB815705)“基因和基因家族/群功能的选择和进化”主持

8.国家基金委重点项目(30830018)“极原始的原生动物--贾第虫的核仁功能基因组与核仁的起源进化探讨”主持

9.云南省应用基础研究计划重点项目(2006C0014Z)“血吸虫防治的分子生物学研究”主持

获奖及荣誉

1)2006年,“核骨架与核纤层的起源进化研究”获“云南省自然科学奖”(二等奖); 2)2000年,“中国蓝氏贾第虫虫株分离培养、基因型及其细胞核研究”获“北京市科学技术进步奖”(二等奖); 3)2000年,第二届“云南省青年科技奖”(共10名) 4)1999年,“涡鞭毛虫(甲藻)及其进化地位的研究”获“云南省自然科学奖”(二等奖);

研究领域

真核细胞的进化基因组学旨在从分子和细胞两个层次上探讨真核细胞的结构、功能和基因、基因组在不同进化地位生物中的多样性及其进化形成的规律和机制。主要以一系列处在关键进化地位的单细胞生物(如贾第虫、眼虫类、衣藻及领鞭毛虫等)为研究对象,向前追溯到原核生物,向后扩展到多细胞生物,开展如下方面的研究:1)真核细胞的重要结构(如核骨架、核纤层、染色质和核仁等)的多样性与进化;2)真核细胞重要功能活动机制(如细胞核分裂、蛋白质定向转运系统、糖酵解、卡尔文循环及脂类代谢等途径等)的多样性与进化;3)与前二者相关的重要基因、基因家族、功能途径基因群和亚基因组(如核仁基因组)的多样性与进化问题;4)从比较与进化基因组学的角度开展生物的特殊适应性进化研究,以发掘有害生物(如“水华”蓝藻、恶性寄生虫如血吸虫等)的特异性防治靶标和开发利用高效、特殊的生物代谢途径。

学术兼职

中国细胞生物学学会理事,中国原生动物学会理事,云南省细胞生物学会理事长民盟中央委员,民盟云南省省委委员,云南省政协委员

近期论文

1.FengJM,TianHF,WenJF*.OriginandEvolutionoftheEukaryoticSSUProcessomeRevealedbyaComprehensiveGenomicAnalysisandImplicationsfortheOriginoftheNucleolus.2013.GenomeBiolEvol,5(12):2255-67.

2.ZhangYJ,YangCL,HaoYJ,LiY,ChenB*,WenJF*.Macroevolutionarytrendsofatomiccompositionandrelatedfunctionalgroupproportionineukaryoticandprokaryoticproteins.2013.Gene,S0378-1119(13)01510-2.

3.XiongJ,LuYM,FengJM,...,MiaoW*.TetrahymenaFunctionalGenomicsDatabase(TetraFGD):anintegratedresourceforTetrahymenafunctionalgenomics.DATABASE-OXFORD.2013.doi:10.1093/database/bat008.

4.XuJ,ChengYQ,ChenB,…,WenJF,….Depressioninsystemiclupuserythematosuspatientsisassociatedwithlink-polymorphismbutnotmethylationstatusofthe5HTTpromoterregion.2013.Lupus.22(10):1001-10.

5.GaoS,XiongJ,…,WenJF,…,MiaoW,andLiuYF.ImpairedreplicationelongationinTetrahymenamutantsdeficientinhistoneH3Lys27monomethylation.2013.GenesDev.27(15):1662-79.

6.SunGL,YangYF,XieFL,WenJF,….DeepSequencingRevealsTranscriptomeRe-ProgrammingofTaxus×mediaCellstotheElicitationwithMethylJasmonate.2013.PLoSONE,8(4):e62865.

7、JiangYH,WangDY,WenJF*.Theindependentprokaryoticoriginsofeukaryoticfructose-16-bisphosphataseandsedoheptulose-17-bisphosphataseandtheimplicationsoftheiroriginsfortheevolutionofeukaryoticCalvincycle.2012.BMCEvol.Biol.12:208

8、NiT,YueJP,SunGL,ZouY,WenJF*,HangJL*.Ancientgenetransferfromalgaetoanimals:Mechanismsandevolutionarysignificance.2012BMCEvol.Biol..12:83

9、FengJM,SunJ,XinDD,WenJF*,ComparativeAnalysisofthe5SrRNAandItsAssociatedProteinsRevealsUniquePrimitiveRatherThanParasiticFeatureinGraidialamblia.2012.PLoSONE.7(6):e36978

10、TianHF,FengJM,WenJF*,Theevolutionofcardiolipinbiosynthesisandmaturationpathwaysanditsimplicationstotheevolutionforeukaryotes.2012BMCEvol.Biol..12:32

11、LinXD,GuoWP,WangW,ZouY,HaoZY,ZhouDJ,DongX,QuYG,LiMH,.TianHF,WenJF,AlexanderPlyusnin,XuJG,ZhangYZ*.MigrationofNorwayRatsResultedintheWorldwideDistributionofSeoulHantavirusToday.2012.JVIROL.86(2):972

12、ChenB,WenJF*,Theadaptiveevolutiondivergenceoftriosephosphateisomerasesbetweenparasiticandfree-livingflatwormsandthediscoveryofapotentialuniversaltargetagainstflatwormparasites.2011Parasitol.Res.,109(2):283-9

13、SunJ,JiangHF,FloresR.,WenJF.*,GeneduplicationinthegenomeofparasiticGiardialamblia.2010BMCEvol.Biol..10:49

14、ZhangYJ,TianHF,WenJF.*TheevolutionofYidC/Oxa/Alb3familyinthethreedomainsoflife:aphylogenomicanalysis.2009BMCEvol.Biol..9:137

15、ZhangYQ,ChenDL,TianHF,ZhangBH,WenJF*Genome-widecomputationalidentificationofmicroRNAsandtheirtargetsinthedeep-branchingeukaryoteGiardialamblia.2009ComputBiolChem..33(5):391-6.

16、SunGL.,ShenW.andWenJF.*,Triosephosphateisomerase(TIM)genesintwotrophicmodesofeuglenoids(Euglenophyceae)andtheirphylogeneticanalysis.2008.J.Eukaryot.Microbiol.55(3):170-177.

17.FengJM,SunJ,WenJF.*Advancesinthestudyofthenucleolus.2012.ZoologicalResearch.33(6):549-556

18.ZhangYJ,WenJF.*YidC/Oxa/Alb3Proteinfamily.2012.ChemistryofLife,32(4)

19.XieGQ,ChenB,WenJF.*ResearchProgressontheMechanismsofImmuneEvasionofParasiticFlatwormssuchasSchistosoma.2013.ActaParasitol.Med.Entomol.Sin22(3):194-201.