浙江大学求是特聘教授，国家重大人才工程特聘教授，药学院教授、博士生导师。现任浙江大学长三角智慧绿洲创新中心（校直属单位，点击访问官网）主任（兼未来健康实验室负责人）、现代中药创制全国重点实验室副主任等。曾任浙江大学药学院副院长及主持工作副院长。 2008年起在浙江大学组建TCM+X实验室，主要从事中医药人工智能AI for TCM、中药系统生物学等交叉学科的教学和科研。先后主持“重大新药创制”国家科技重大专项、澳大利亚NHMRC ideas grant、国家自然科学基金等课题20余项，与阿里巴巴、康恩贝、万邦德、宁波市中医院等共建校企联合研究中心，牵头完成了多个中药大品种的科学内涵诠释及技术升级改造。以第一或通讯作者在Nature Machine Intelligence, Cell Genomics, Nature Communications, Trends in Biotechnology, Nucleic Acids Research, Advanced Science, Cell Reports Medicine 等发表SCI 收录论文100 余篇，授权发明专利和软件著作权50 余件。科研成果获2022年度中医药十大学术进展、国家科学技术进步一等奖2 项（排名3/15、5/15）、国家科学技术进步二等奖1项以及省部级科技奖励多项；教学成果获国家教学成果二等奖、浙江省教学成果一等奖及全国药学专业学位研究生教育教学成果一等奖等。 荣誉及奖励 - 第十届树兰医学青年奖（2023） - 中医药十大学术进展（2022） - 浙江大学求是特聘教授（2022） - 宝钢优秀教师奖（2022） - 高等学校科学研究优秀成果二等奖（2022，排名第一） - 国家重大人才工程特聘教授（2021） - 浙江省教学成果一等奖（2021，排名第一） - 首批国家中医药交叉创新团队（2020） - 全国药学专业学位研究生教育教学成果一等奖（2020，排名第一） - 庆祝中华人民共和国成立70周年纪念章（2019） - 第十届“三育人”先进个人（2019） - 第六届师德先进个人（2019） - 浙江大学求是特聘科研岗（2019） - 国家药典委员会委员（2017） - 国家“计划”青年拔尖人才（2015） - 国家科技进步一等奖（2014，排名第五） - 美国FDA Faculty Research Participation Program（2014） - 国家科技进步一等奖（2013，排名第三） - 教育部新世纪优秀人才（2012） - 浙江省新世纪151人才（2010） - 浙江省杰出青年基金（2009）

中医药人工智能 AI for TCM 单细胞时空转录组方法及应用 Single-cell Omics/Spatially Resolved Transcriptomics 中药系统生物学 TCM systems biology 组分中药及健康产品研发 R&D of Natural Products

主要研究兴趣 课题组（TCM+X实验室）致力于开发多学科交叉方法和手段，诠释中医药现代科学内涵，实现中药现代“话”。近年的研究重点包括 - 中医药人工智能AI for TCM - 单细胞时空组学方法及应用 - 中药系统生物学 - 组分中药及健康产品研发

担任《中国药典（英文版）》以及Chinese Medicine、Experimental Biology and Medicine、Journal of Natural Medicines、Chinese Journal of Natural Medicines等多本SCI期刊副主编/编委，Nature, Science, Nature Reviews Methods Primers, Nature Biomedical Engineering, Nature Machine Intelligence, Nature communications, Nature Protocols 等期刊审稿人。兼任国际MAQC学会主席（President-Elect）、中华中医药学会青年委员会副主委、世中联网络药理学专委会副会长、中西医结合学会临床药理与毒理专业委员会副主委、中西医结合学会中药专委会副主委、中华中医药学会中药产业发展与监管科学研究高端智库副主任委员、国家药典委员会委员等。

Recent Publications Penghui Yang†, Lijun Jin†, Jie Liao†, Kaiyu Jin, Xin Shao, Chengyu Li, Jingyang Qian, Junyun Cheng, Dingyi Yu, Rongfang Guo, Xiao Xu, Xiaoyan Lu*, Xiaohui Fan*. Revealing spatial multimodal heterogeneity in tissues with SpaTrio. Cell Genomics, 2023, 3(12): 100446. (Github网址：https://github.com/ZJUFanLab/SpaTrio） Dingyi Yu, Penghui Yang, Xiaoyan Lu*, Shaoze Huang, Li Liu*, Xiaohui Fan*. Single-cell RNA sequencing reveals enhanced antitumor immunity after combined application of PD-1 inhibitor and Shenmai injection in non-small cell lung cancer. Cell Communication and Signaling, 2023, 21, 169. Jingyang Qian†, Jie Liao†*, Ziqi Liu†, Ying Chi†, Yin Fang, Yanrong Zheng, Xin Shao, Bingqi Liu, Yongjin Cui, Wenbo Guo, Yining Hu, Hudong Bao, Penghui Yang, Qian Chen, Mingxiao Li, Bing Zhang*, Xiaohui Fan*. Reconstruction of cell pseudo-space from single-cell RNA sequencing data with scSpace. Nature Communications. 2023, 14(1):2484. (Editor's Highlights, Github网址：https://github.com/ZJUFanLab/scSpace) Yin Fang, Qiang Zhang*, Ningyu Zhang, Zhuo Chen, Xiang Zhuang, Xin Shao, Xiaohui Fan*, Huajun Chen*. Knowledge graph‐enhanced molecular contrastive learning with functional prompt. Nature Machine Intelligence. 2023, 21 (5): 323-332. Junyun Cheng†, Jie Chen†, Jie Liao, Tianhao Wang, Xin Shao, Jinbo Long, Penghui Yang, Anyao Li, Zheng Wang, Xiaoyan Lu*, Xiaohui Fan*. High-throughput transcriptional profiling of perturbations by Panax ginseng saponins and Panax notoginseng saponins using TCM-seq. Journal of Pharmaceutical Analysis. 2023, 13(4):376-387. Junyun Cheng†, Gaole Lin†, Tianhao Wang†, Yunzhu Wang, Wenbo Guo, Jie Liao, Penghui Yang, Jie Chen, Xin Shao, Xiaoyan Lu, Ling Zhu, Yi Wang*, Xiaohui Fan*. Massively Parallel CRISPR-based Genetic Perturbation Screening at Single-cell Resolution. Advanced Science. 2023. 10(4):e2204484. Li Shao†, Hong Zhao†, Rongfang Guo†, Jinlin Cheng, Xiaoyan Lu*, Xiaohui Fan*. Biopsy-based single cell transcriptomics reveals MAIT cells as potential targets for controlling fibrosis-related liver inflammation due to chronic hepatitis-B infection. Clinical and Translational Medicine. 2022, 12(10):e1073. Jie Liao†, Jingyang Qian†, Yin Fang†, Zhuo Chen†, Xiang Zhuang†, Ningyu Zhang, Xin Shao, Haihong Yang, Penghui Yang, Junyun Cheng, Yang Hu, Yining Hu, Lingqi Yu, Jinlu Zhang, Xiaoyan Lu, Li Shao, Dan Wu, Yue Gao*, Huajun Chen*, Xiaohui Fan*. De novo analysis of bulk RNA-seq data at spatially resolved single-cell resolution. Nature Communications. 2022, 13(1):6498. (Editor's Highlights, Top 25 life and biological sciences articles from 2022) （Bulk2space可将传统RNA-seq数据解析为单细胞水平空间转录组数据，Github网址：https://github.com/ZJUFanLab/bulk2space）