杜艺岭 照片

杜艺岭

研究员

所属大学: 浙江大学

所属学院: 医学院

邮箱:
yldu@zju.edu.cn

个人主页:
https://person.zju.edu.cn/yiling_du

个人简介

杜艺岭,浙江大学基础医学院微生物系和药物生物技术研究所“计划”研究员,博士生导师,入选国家级人才计划青年项目、国家自然科学基金委优秀青年基金项目和浙江省杰出青年基金项目。实验室长期聚焦于研究与人体健康密切相关的微生物合成代谢过程的生化分子机理、微生物源药物的生物合成机理及其在生物医药与合成生物学领域的应用,近年来以通讯作者在《自然化学生物学》、《自然通讯》和《德国应用化学》等国际权威杂志上发表了多篇研究论文。 微生物是自然界的化学家,其基因组上编码着众多生理活性小分子化合物的遗传信息。这些遗传信息(genetic code)可以在特定条件下通过微生物体内的多种生物合成途径(biosynthetic pathway)转译成小分子化合物的化学结构信息(chemical structures)。以上这些微生物基因组编码的小分子具有新颖的化学结构和显著的生理活性,广泛参与了微生物致病、微生物与宿主相互作用、微生物种间与种内信息交流等多种过程。同时,这些微生物来源的小分化合物及其衍生物也是临床药物(如抗生素和抗肿瘤药物等)的重要来源之一。因此,对上述这些小分子的 “from genes to molecules” 的生物化学过程的研究具有重要意义。 本实验室主要通过生物化学与分子生物学、基因组学、合成生物学、天然药物化学、结构生物学等多学科技术手段,研究 (1) 微生物源功能分子(如抗生素和致病因子等)生物合成过程的生物化学与基因调控机理(Nat. Chem. Biol., 2023;Nat. Commun., 2020; Angew. Chem. Int. Ed., 2021等) (2) 基于微生物基因组学与合成生物学技术的微生物源功能分子(如抗肿瘤天然药物)的发现、优产和分子创新(Nat. Chem. Biol., 2019等) (3) 新颖生物合成酶家族的结构与功能研究及其在生物催化和合成生物学领域的应用(Nat. Commun., 2021;Nat. Chem. Biol., 2017等) Microbes produce a variety of drug molecules with diversified chemical structures and biological activities. These molecules, also known as natural products, are essential to human health and have been used to combat infectious bacteria and fungi. Working at the interface of microbiology and chemistry, the research in our lab integrates microbial genetics, molecular biology and biochemistry, organic chemistry and structural biology approaches to study natural product biosynthetic machinery. The goals is to answer the following questions (1) how are the genetically coded small molecules (such as antibiotics and natural product drugs) made by microbes ? (2) how can we harness their biosynthetic machinery to develop new strategies for the discovery of new antibiotics and clinical drugs ? (3) can we utilize novel biocatalysts of microbial origin for the assembly of de novo pathways to produce high-value chemicals and drugs ? 欢迎有医学与药学、微生物学、有机化学、结构生物学等专业背景的优秀学生报考实验室研究生!诚邀优秀博士毕业生到实验室进行博士后研究!

研究领域

重要微生物次级代谢过程的遗传与生物化学机理 微生物源功能小分子(致病因子和抗生素等)的发现与合成代谢机理 微生物基因组学驱动的药物发现与合成生物学制造

近期论文

代表性论文 - Wei Li, Ziyang Cheng, Zhijie Zhao, Hu Li, Yu Liu, Xingyu Lu, Guiyun Zhao, Yi-Ling Du* (2024) Discovery of a a bacterial hydrazine transferase that constructs the N‑aminolactam pharmacophore in albofungin biosynthesis. Journal of the American Chemical Society, doi: 10.1021/jacs.4c02311. - Xinjie Shi, Guiyun Zhao, Hu Li, Zhijie Zhao, Wei Li, Miaolian Wu, Yi-Ling Du* (2023) Hydroxytryptophan biosynthesis by a family of heme-dependent enzymes in bacteria. Nature Chemical Biology, doi: 10.1038/s41589-023-01416-0. - Jingkun Shi, Xin Zang, Zhijie Zhao, Zhuanglin Shen, Wei Li, Guiyun Zhao, Jiahai Zhou*, Yi-Ling Du* (2023) A conserved enzymatic cascade for bacterial azoxy biosynthesis. Journal of the American Chemical Society, doi: 10.1021/jacs.3c12018. - Guiyun Zhao, Wei Peng, Kaihui Song, Jingkun Shi, Xingyu Lu, Binju Wang* & Yi-Ling Du* (2021) Molecular basis of enzymatic nitrogen-nitrogen formation by a family of zinc-binding cupin enzymes. Nature Communication, 12, 7205, doi: 10.1038/s41467-021-27523-x . - Xinjie Shi, Liming Huang, Kaihui Song, Guiyun Zhao, Yu Liu, Longxian Lv, Yi-Ling Du* (2021) Enzymatic Tailoring in Luzopeptin Biosynthesis Involves Cytochrome P450-Mediated Carbon-Nitrogen Bond Desaturation for Hydrazone Formation. Angewandte Chemie International Edition, doi: 10.1002/anie.202105312. - Guiyun Zhao, Yuan-Yang Guo, Shunyun Yao, Xinjie Shi, Longxian Lv, Yi-Ling Du*(2020) Nitric oxide as a source for bacterial triazole biosynthesis. Nature Communications, doi: 10.1038/s41467-020-15420-8. - Yi-Ling Du*, Melanie A Higgins, Guiyun Zhao, Katherine S Ryan* (2019) Convergent biosynthetic transformations to a bacterial specialized metabolite. Nature Chemical Biology,15, 1043–1048