个人简介
1994南京大学生物系学士 1997北京大学细胞遗传系硕士 2005约翰霍普金斯医学院生物物理系博士 2011斯坦福大学发育生物学系博士后 2012清华大学生命科学学院研究员 2018首都师范大学生命科学学院特聘教授
学术报告
A）组织学术会议
第19界线虫大会神经科学会场，洛杉矶，美国，2013年6月，共同主持
B）受邀讲座
“AConservedRegulatoryNetworkUnderlyingtheDevelopmentofLateralNeuralBordersinbilateria”
第1界亚洲进化大会，2018年4月18日
“AConservedRegulatoryNetworkforALateralNeuralPlateBorderLineagefromWormtoVertebrate”
亚利桑那大学神经科学系，2017年2月15日
C）会议选用报告
“AConservedRegulatoryNetworkforALateralNeuralPlateBorderLineageFromWormToVertebrate”
第21界线虫大会生态和进化会场，洛杉矶，美国，2017年6月
荣誉和奖项
2018北京市高层次人才资助计划
2007LarryL.HillblomFoundationPosdoctoralFellowship
2005PhiBetaKappa
研究领域
实验室从功能基因组学和系统生物学角度，主要以线虫神经系统为模型，探索细胞命运决定和多样化的分子机制。目前重点在线虫建立单细胞精度的基因表达图谱，发现基因调控网络的未知属性，并揭示它们在神经细胞命运决定中的作用，认识神经系统多样性的分子发育基础。为实现这一目标，我们开发和利用多种高通量实验方法，包括单细胞精度转录组技术和单细胞精度线虫影像分析系统。同时，我们开发基因组学技术，高效组装非模式动物的基因组。通过开发非模式动物的基因组和遗传资源，开展细胞发育生物学研究。
近期论文
1.Ren,X.,Li,R.,Wei,X.,Bi,Y.,Ho,W.,Ding,Q.,Zhang,Z.,Young,A.,Tsieh,C.,Zeng,J.,Liu,X.*andZhaoZ.*(2018)GenomicbasisofrecombinationsuppressioninthehybridbetweenCaenorhabditisbriggsaeandgonochoristicC.nigoni.NucleicAcidsResearch46,1295.*:correspondingauthor
2.Li,Y.,Zhao,D.,Horie,T.,Chen,G.,Bao,H.,Chen,S.,Liu,W.,Horie,R.,Liang,T.,Dong,B.,Feng,Q.,Tao,Q.andLiu,X.*.(2017)AConservedGeneRegulatoryModuleSpecifiesLateralNeuralBordersAcrossBilaterians.PNAS114,E6352
3.Liu,W.,Yu,E.,Chen,S.,Ma,X.,Lu,Y.andLiu,X.*.(2017)SpatiotemporalprofilingoflonginterveningnoncodingRNAsinCaenorhabditiselegans.ScientificReports7,5195
4.Wei,X.,Xu,Z.,Wang,G.,Hou,J.,Ma,X.,Liu,H.,Liu,J.,Chen,B.,Luo,M.,Xie,B.,Li,R.,Ruan,J.andLiu,X.*.(2017)pBACode:arandom-barcode-basedhigh-throughputapproachforBACpaired-endsequencingandphysicalclonemapping.NucleicAcidsRsearch45,e52
5.Ma,X.,Zhan,G.,Sleumer,M.C.,Chen,S.,Liu,W.,Zhang,M.Q.andLiu,X.*.(2016)AnalysisofC.elegansmuscletranomeusingtrans-splicing-basedRNAtagging(SRT).NucleicAcidsRsearch44,e156
6.Liu,X.,Long,F.,Peng,H.,Aerni,S.J.,Jiang,M.,Sánchez-BlancoA.,Murray.J.I.,Preston,E.,Mericle,B.,Batzoglou,S.,Myers,G.,andKim,S.K.(2009).Analysisofcellfatefromsingle-cellgeneprofilesinC.elegans.Cell139:623-633
7.Liu,X.,C.K.Lee,N.D.Clarke,andJ.D.Lieb(2006)QuantificationofchromatincontributionstoDNA-bindingsiteutilization.GenomeRes.16:1517–1528
8.Liu,X.,Noll,D.M.,Lieb,J.D.,andClarke,N.D.(2005)DIP-chip:RapidandaccuratedeterminationofDNA-bindingspecificity.GenomeRes.15:421–427
9.Liu,X.andClarke,N.D.(2002)Rationalizationofgeneregulationbyaeukaryotictranionfactor:calculationofregulatoryregionoccupancyfrompredictedbindingaffinities.J.Mol.Biol.323:1-8.